Практическое задание: Составить доклад по теме «SNP-метод» (роль метода в биотехнологии, основные задачи метода)

Поскольку данные виды выращиваются в питомнике со вполне конкретными селекционными целями, поэтому видовая идентификация здесь – крайне важный этап. Наличие либо отсутствие SNP помогает в этом.
Обнаружить его можно по-разному: обычным секвенированием либо созданием CAPS-маркера. Второй способ предпочтительнее вследствие его небольшой стоимости и маленькой погрешности, которая статистически вовсе нивелируется. Если SNP находится в сайте рестрикции какой-либо рестриктазы, то при замене рестриктаза перестанет его узнавать, следовательно, уже не может его разрезать. Так же можно использовать некоторые модификации метода ПЦР, заточенные под поиск однонуклеотидных замен.
SNP в медицине и криминалистике
Снипы также находят применение в медицине для демонстрации корреляции генотипа и реакции на лечение, что важно для фармакогеномики.Разнообразие возможных вариантов снипов в человеческих ДНК непосредственным образов влияет на течение той или иной болезни, формирование иммунного ответа, резистентность и чувствительность к химическим реагентам, лекарствам, вакцинам и т.д.
К примеру, наличие SNP в гене N-ацетил трансферазы NAT-2 связывают с таким заболеванием, как периферийная невропатия, она проявляется в слабости, потери чувствительности конечностей при возможной терапии изониазидом. При обнаружении подобного снипа в геноме человеку назначают другое лечение, тем самым избегая неприятных побочных эффектов.
В клинических исследованиях SNP используют при сравнении областей генома между когортами (например, с совпадающими когортами с заболеванием и без него) в исследованиях общегеномных ассоциаций.SNP-метод используется в полногеномных ассоциативных исследованиях в качестве маркеров высокого разрешения при картировании генов, связанных с заболеваниями или нормальными признаками. Снипы могут быть причинами возникновений «молчащих мутаций», которые не оказывают заметного влияния на фенотип, и такие мутации также полезны в качестве генетических маркеров.
В криминалистике данный метод с давних пор используется при сравнении ДНК-проб с целью подтверждения вины подозреваемого. Но в настоящее время этот метод редко используется из-за стремительно развивающейся дактилоскопии. Однако развитие технологии секвенирования следующего поколения (NGS) может открыть больше возможностей для использования SNP в фенотипических ключах, таких как этническая принадлежность, цвет волос и цвет глаз, с хорошей вероятностью совпадения. Это может дополнительно применяться для повышения точности реконструкций лица за счет предоставления информации, которая в противном случае могла бы быть неизвестной, и эту информацию можно использовать, чтобы помочь идентифицировать подозреваемых даже без совпадения профиля ДНК.
Некоторые SNP связаны с метаболизмом разных лекарств. SNP могут быть мутациями, такими как делеции, которые могут ингибировать или стимулировать ферментативную активность; такое изменение ферментативной активности может привести к снижению скорости метаболизма лекарств. Можно установить связь широкого спектра заболеваний человека, таких как рак, инфекционные (проказа, гепатит и т. д.), аутоиммунные, психоневрологические и многие другие заболевания с разными SNP. в качестве актуальных фармакогеномных мишеней для лекарственной терапии.
Данные об SNP играют роль и в эволюционной биологии, давая ключ к пониманию исторических изменений размеров популяций, а также при построении моделей миграций.